医院工会组建于1950年8月，属广西医学院文教工会，由学院工会领导，“文化大革命”后，工会活动停止。于1977年恢复工会组织活动，1982年成立医院工会。

目前，工会在医院党委和上级工会的领导下，遵照中国工会章程，认真履行工会四项职能积极开展工作。工会现设有主席1人；副主席1人；工会委员9人；经费审查委员3人；女工委员3人；专职工会干部6人。全院成立分工会30个，分工会主任由各党支部委员兼任。