儿童血液系统专业分设血液病病房、日间化疗病房、造血干细胞移植病房、地贫之家四个治疗单元，涵盖了儿童白血病、淋巴瘤、贫血与红细胞疾病、出血性疾病、地贫与造血干细胞移植、组织细胞病、儿童舒缓治疗等7个亚专业。国家临床重点专科-地方病科（地中海贫血）、广西儿童白血病/肿瘤定点治疗单位及南宁市地贫定点治疗单位；是中国儿童早幼粒细胞白血病协作组成员单位，华南地区儿童急性淋巴细胞白血病、淋巴瘤、神经母细胞瘤（IV）诊疗协作组成员单位、多中心儿童急性髓细胞白血病协作组单位。1986年在广西最先开展儿童白血病诊疗，目前对儿童血液肿瘤性疾病使用了国内外规范的MICM分型诊断，目前儿童急性淋巴细胞白血病的诱导缓解率及治愈率均达到国内先进水平。优势专科项目：

      1.国内先进、区内前列：新生儿脐带血加新生儿/婴儿骨髓造血干细胞移植技术 、地中海贫血系统管理（输血、祛铁、干细胞移植）、儿童急性白血病和淋巴瘤及组织细胞病（噬血细胞综合征、朗格汉斯细胞组织细胞增生症）的诊疗、小儿输液港的使用及维护；

      2.区内前列：儿童遗传性血液病（出凝血疾病、溶血性疾病、血小板减少症、先天性骨髓衰竭等）诊疗技术、儿童罕见遗传代谢性疾病诊疗技术（肾上腺疾病、性腺发育异常疾病、先天性高胰岛素血症、新生儿糖尿病、尿崩症、肌营养不良及多种遗传代谢病）、儿童生长发育异常（生长激素缺乏症、特发性矮小、Turner 综合征、小于胎龄儿、Shox 基因缺乏症、Prader-Willi综合症、Noonan 综合征等）。