本专业在2003年区内最早开展小儿腹腔镜微创手术，历经十余年的努力，目前已成熟应用于儿童胃肠、肝胆、泌尿、新生儿外科等领域，包括胆总管囊肿、先天性巨结肠、胆道闭锁、肾积水、重复肾畸形、巨脾及脾功能亢进、食道闭锁、膈膨升、膈疝、隐睾、腹股沟疝、鞘膜积液等疾病。目前在传统腹腔镜技术基础上，不断探索，成功开展经脐单孔腹腔镜手术和达芬奇机器人手术，包括巨结肠根治术、脾切除术、肾盂成形术、输尿管膀胱再植术、重复肾切除术、腹腔肿瘤切除、睾丸下降固定术等。使术口更为微创及美观，操作技术更细腻，经脐单孔腹腔镜技术和达芬奇机器人手术的成功开展，技术不断成熟，标志着本专业微创手术水平达到国内先进。

包括显性或隐性脊柱裂，脊髓脊膜膨出、脊髓纵裂、脊髓表皮样囊肿、脂肪瘤型脊髓栓系等神经系统畸形引起的大小便及下肢功能障碍。本科室汇集了全区90%以上的病例，目前收治的病例已超过400余例，近十年来应用显微外科技术，创新性地采用硬膜内外腔联合松解脊髓栓系技术，通过全面、精准的脊髓及神经松解、椎管扩大减压，骶囊重建术。手术完全松解率达到90%，术后恢复优良率80%以上，达到国内先进水平。

本专业能够解决新生儿外科涉及普外、泌尿、普胸的相关疑难危重症，比如新生儿肠闭锁、肥厚性幽门梗阻、环状胰腺、先天性直肠肛门畸形、膈疝、食道闭锁等。近年来逐渐开展新生儿外科的微创治疗，包括腹腔镜及胸腔镜手术，在保证手术质量的前提下，更好的提供医疗服务。

区内唯一长期收治小儿实体肿瘤的医疗单位，本专业在肝母细胞瘤、肾母细胞瘤、神经母细胞瘤、睾丸肿瘤、横纹肌肉瘤、畸胎瘤、血管瘤、淋巴管瘤以及其它软组织肿瘤等疾病的诊治方面，已积累1000余例的宝贵经验，通过手术+化疗+放疗或术前新辅助化疗+手术+再化疗+放疗的治疗方法，恶性实体肿瘤手术完整切除率达85%，熟练掌握各种复杂肝脏肿瘤切除、下腔静脉瘤栓、中晚期恶性肿瘤切除及联合脏器切除等高难度手术。患儿3年生存率接近80%。目前积极开展肿瘤多学科诊疗模式能够更精准的为肿瘤患儿提供个性化治疗方案。2016年以来广泛开展输液港和经外周静脉置管等技术为患儿提供国内先进的医疗服务。

作为本专业最具特色的优势学科，在尿道下裂矫形、肾积水微创治疗、隐睾微创治疗、后尿道瓣膜治疗、外伤性尿道断裂修复重建、儿童性别发育障碍鉴别与治疗等方向均达到国内先进水平。其中每年完成尿道下裂矫形手术近600余例，始终保持全区病例数量最大，治疗效果最好，一期尿道成形术85%以上，分期手术成功率达到90%。对多次手术失败的尿道下裂再次修复具有丰富的经验。尿道下裂相关研究成果获得2014年广西科技进步二等奖及广西卫生适宜技术推广奖三等奖各一项。近年来广泛开展小儿泌尿外科微创手术，包括小切口手术、腹腔镜手术、达芬奇机器人辅助手术，治疗效果良好。2015年以来开展儿童性别发育障碍多学科诊疗模式能够更精准的解除患儿痛苦，也更符合医学伦理学要求。

作为国内最早开展胆总管囊肿根治胆道重建、直肠肛门畸形矫治和巨结肠根治的医疗单位之一，经过四十余年的沉淀，本专业对于小儿普外疾病积累了丰富的临床经验，治疗效果均达到国内先进水平。在国内率先报道胆总管囊肿囊内剥离切除技术，显著降低了门静脉及肝动脉损伤的几率，随着技术的进步，这些疾病的治疗手术由大切口转变为微小切口及腹腔镜辅助完成。近二十年来我科先天性巨结肠治疗由传统的改良Rehbin术、Soave术、Duhamel术过度到现今流行的经肛门巨结肠根治术。随着技术不断成熟，目前借助常规的腹腔镜乃至经脐单孔腹腔镜技术可高质量地完成几乎所有类型的巨结肠根治术。另外对多次手术复发及巨结肠术后严重并发症的病例，如吻合口崩裂、肠管回缩、复杂肛瘘及“冰冻”骨盆等的处理具有丰富的经验。熟练完成门脉海绵样变引起的肝前性门脉高压的断流及分流手术，对胆道损伤的修复积累了丰富经验。近十年来开展胆道闭锁kasai肝门空肠吻合术，疗效显著，近三分之一的病患能够以自体肝存活。2017年7月开始在天津市中心医院和本院肝胆外科的支持下开展儿童肝移植手术，目前已完成20余例，包括亲体肝移植及异体肝移植，成功率达90%，是广西唯一的儿童肝移植医疗中心，2017年肝移植例数在全国儿童肝脏移植中心排名第七。