广西医科大学泌尿科学研究所于成立2004年11月，现任所长为莫曾南教授为。泌尿科学研究所包括泌尿外科一病区、二病区、肾内科病区、血液净化中心和人类精子库。2009年3月泌尿科学研究所成为广西医疗卫生重点建设学科，是博士/硕士学位授予点，博士后流动站，2019年12月获广西泌尿系统疾病临床医学研究中心。研究所现有医生58人（含返聘2人），技术员5人，博士生导师3人，硕士研究生导师20人，有博士学位者34人（含在读）。正高职称17人（含返聘2人），副高职称12人。在泌尿系结石、前列腺疾病、泌尿系统肿瘤、男科疾病、肾脏移植、肾小球疾病、肾脏病理、腹膜透析、血液净化等方面处于国内及广西领先地位。

泌尿外科年门诊46000人次、住院病人7100人次、手术7000台次，微创手术比例占每年科室手术总量的90%以上。患者来源覆盖全广西，还包括云南、湖南、贵州和广东等周边省份。除了从事泌尿外科临床医疗、干部保健工作以及医学本科、硕士、博士和留学生的日常教学工作以外，科室每年还承担各地医院进修医生的培养工作，成为了广西泌尿外科临床医疗、教学、科研的中心和培养中高级泌尿外科医师的摇篮。此外，泌尿外科是“中华医学会泌尿外科学分会泌尿系结石华南临床诊疗技术培训基地”南宁中心，负责华南地区泌尿系结石临床诊疗技术的培训工作，也是全国基层医疗机构合理用药培训项目实践培训基地。

肾内科专业组于1973年3月建立，1975年开展腹膜透析技术，1978年建立血透室，1985年建立泌尿实验室，1993年开展B超引导下自动活检肾穿刺术诊断肾脏疾病，2009年起在广西唯一常规开展肾脏病理电镜检查，为疑难肾脏病的诊断及个体化治疗方案提供保障。2011年6月成为全国首批、广西唯一的 “卫生部腹膜透析培训示范中心”的医疗单位。2012年获卫生部全国县级医院血液净化培训基地，2013年获得国际肾脏病学会ISN-中国AKF 0 BY 25项目唯一的广西基地。肾内科学组年均出院病人近4000人次，年门诊量近7万人次，血液净化年均近3万人次。

人类精子库于2013年6月正式批准试运行，目前为我国第18家被批准设立、广西境内唯一一家人类精子库，该库是集医疗、科研为一体的专业人类精子冷冻机构，主要从事捐精志愿者的精液冷冻保存、生殖保险和人类精子低温冷冻研究等工作。